MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402

Total Repeats: 48562

< Previous12...86878889909192939495969798Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_011999	ACA	2	6	2099168	2099173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152197
48502	NC_011999	CCA	2	6	2099189	2099194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222152197
48503	NC_011999	CTTGCA	2	12	2099267	2099278	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222152197
48504	NC_011999	CAA	3	9	2099310	2099318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152197
48505	NC_011999	CAT	2	6	2099322	2099327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152197
48506	NC_011999	TCC	2	6	2099347	2099352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48507	NC_011999	CAT	2	6	2099397	2099402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152198
48508	NC_011999	CTG	2	6	2099487	2099492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152198
48509	NC_011999	A	6	6	2099593	2099598	100 %	0 %	0 %	0 %	222152198
48510	NC_011999	TTC	2	6	2099614	2099619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152198
48511	NC_011999	TTC	2	6	2099623	2099628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152198
48512	NC_011999	TTG	2	6	2099635	2099640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152198
48513	NC_011999	CTT	2	6	2099691	2099696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152198
48514	NC_011999	TAA	2	6	2099730	2099735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152198
48515	NC_011999	T	6	6	2099753	2099758	0 %	100 %	0 %	0 %	222152198
48516	NC_011999	ATT	2	6	2099759	2099764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152198
48517	NC_011999	ATT	3	9	2099800	2099808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152198
48518	NC_011999	ATAC	2	8	2099811	2099818	50 %	25 %	0 %	25 %	222152198
48519	NC_011999	T	6	6	2099868	2099873	0 %	100 %	0 %	0 %	222152198
48520	NC_011999	CGC	2	6	2099928	2099933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222152198
48521	NC_011999	TAT	2	6	2099997	2100002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152198
48522	NC_011999	CAA	2	6	2100051	2100056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152198
48523	NC_011999	AGA	2	6	2100107	2100112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152198
48524	NC_011999	CTTC	2	8	2100122	2100129	0 %	50 %	0 %	50 %	222152198
48525	NC_011999	CTT	2	6	2100141	2100146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152198
48526	NC_011999	TAG	2	6	2100162	2100167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152198
48527	NC_011999	CTT	2	6	2100168	2100173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152198
48528	NC_011999	CAT	3	9	2100177	2100185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152198
48529	NC_011999	CTG	2	6	2100280	2100285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152198
48530	NC_011999	TCG	2	6	2100333	2100338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152198
48531	NC_011999	TTC	2	6	2100360	2100365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152198
48532	NC_011999	AATT	2	8	2100471	2100478	50 %	50 %	0 %	0 %	222152198
48533	NC_011999	TAAT	2	8	2100578	2100585	50 %	50 %	0 %	0 %	222152198
48534	NC_011999	TA	3	6	2100624	2100629	50 %	50 %	0 %	0 %	222152198
48535	NC_011999	CCT	2	6	2100741	2100746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48536	NC_011999	AAT	2	6	2100780	2100785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48537	NC_011999	CT	3	6	2100888	2100893	0 %	50 %	0 %	50 %	222152199
48538	NC_011999	TGT	2	6	2100914	2100919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152199
48539	NC_011999	T	7	7	2101005	2101011	0 %	100 %	0 %	0 %	222152199
48540	NC_011999	GAT	2	6	2101103	2101108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152199
48541	NC_011999	ATT	2	6	2101165	2101170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152199
48542	NC_011999	CTG	2	6	2101181	2101186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152199
48543	NC_011999	ATA	2	6	2101198	2101203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152199
48544	NC_011999	ATAC	2	8	2101271	2101278	50 %	25 %	0 %	25 %	222152199
48545	NC_011999	TTG	2	6	2101299	2101304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152199
48546	NC_011999	T	6	6	2101548	2101553	0 %	100 %	0 %	0 %	222152199
48547	NC_011999	TCT	2	6	2101561	2101566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152199
48548	NC_011999	TCC	2	6	2101605	2101610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48549	NC_011999	TGT	2	6	2101684	2101689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152200
48550	NC_011999	ATC	2	6	2101726	2101731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152200
48551	NC_011999	TAA	2	6	2101734	2101739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152200
48552	NC_011999	TCT	2	6	2101742	2101747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152200
48553	NC_011999	AT	3	6	2101870	2101875	50 %	50 %	0 %	0 %	222152200
48554	NC_011999	TTC	2	6	2101934	2101939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152200
48555	NC_011999	ATACG	2	10	2101943	2101952	40 %	20 %	20 %	20 %	222152200
48556	NC_011999	TCA	3	9	2101976	2101984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48557	NC_011999	TTAT	2	8	2101995	2102002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48558	NC_011999	A	8	8	2102031	2102038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48559	NC_011999	ATA	2	6	2102069	2102074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48560	NC_011999	ACG	4	12	2102088	2102099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48561	NC_011999	TACGT	2	10	2102106	2102115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48562	NC_011999	ACT	2	6	2102270	2102275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...86878889909192939495969798Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.